Nature：风险！微生物组可能披露个人隐私

源于全人类粪便的细菌DNA可作为“消化系统纹”（gut print）来比对与生俱来身为。通过寄居某生理内的有机体DNA可比对借助于此人的身为。分析人员推测，通过寄居生理的有机体功能强大DNA，需要甲基化地比对借助于与生俱来的身为，这就造成了与生俱来资料疑问。这项推测登载于5月11日的《American第三世界科学院科学杂志》（Proceedings of the National Academy of Sciences）上。文章指借助于，在一项博客试验适度分析里面，通过寄生于生理的有机体（即其有机体两组），很有意味著比对借助于与生俱来身为，从而发觉某人的健康状况、饮茶以及群体等具体内容信息。无独有偶，4月29日发表于《基因两组分析》（Genome Research）的一项分析也声称，在由NIH保障的即时适度有机体两组DNA数据库里面，也含有具备潜在辨识适度的全人类DNA。当然，两篇论文均未依据有机体两组的信息披露借助于受试者的借助于处——据估计迄今这么做也但会很困难——但他们有提借助于，这种具有引导适度的有机体两组分析应该得到备案。来自马萨诸塞州波斯顿哥伦比亚大学陈曾熙预防学院（Harvard T. H. Chan School of Public Health）的计数生物学家Curtis Huttenhower牵头了这项最新借助于炉的分析。他声称，迄今，有机体两组的数据库管理还带着点儿西部荒原的意思。但随着整个领域的发展，人们需要切实地注意到，他们的有机体两组具有整体的甲基化。毕竟这事并不新鲜，全人类基因两组分析早就因为该软件疑问受到了数年的重视。2013年，有研究者宣布，他们能在一项国际适度的***基因两组这两项（1,000 Genomes project）里面，具体借助于5位博客受试者的借助于处，这是通过参照其DNA以及宗族谱系文档（包含年纪、住地和姓氏）发觉的。近年来，有机体两组对全人类的健康与行为的影响已渐渐成为分析的近期。而全人类有机体两组分析所得的数据库常常都以公开贮存库作为最后的归宿，但随着时间的推移，这些有机体两组是不是需要持久适度地比对借助于所属特定的人，迄今尚未清楚。Huttenhower的工作团队透过源于NIH全人类有机体两组计划（HMP）的公开数据库，查找独有生理各个部位的采样（包括消化系统、口腔、表皮和），以将这些同时具有特定比对适度和时间稳定适度的有机体基因标记两组合成起来（尽管HMP无法比对借助于与生俱来借助于处，但辨识借助于采样的捐献先后顺序（数周前或数月前）还是意味著的。）。除此以外，粪便采样能提供最佳的有机体比对标志：在86%的完全，一与生俱来的首次采样能与其二次采样相关联。而表皮采样能获取有用匹配的比率只有大约四分之一。分析者还指借助于，在比对与生俱来方面，基于个体有机体菌株的DNA标记能不可忽视最佳作用，它比那些基于有机体几类的比对方法要好得多。对于工作团队的成果，Huttenhower总结道，这应该就是“透过有机体两组数据库，通过单一试验适度，即可非凡适度地挑战所有疑问”。他看来，意味著起因的该软件可能适度补丁深知在于分析方案上，比如某人参予了两项不同的有机体两组分析，若每一两组都含有完全相同的补充信息（诸如年纪及健康状况），那就意味著显现发觉。不过，有机体两组本身就意味著造成该软件可能适度，因为它们必然地与全人类DNA纠缠不休。尽管NIH已然竭力思考如何去除全人类DNA的方法，以防其进入HMP文档，但结果不容乐观。据加州劳伦斯利弗莫尔第三世界实验室（Lawrence Livermore National Laboratory）的一位计数生物学家、工作团队带头人Jonathan Allen推测，采样的污染源疑问仍普遍发挥作用。该工作团队注意到，短串联重复核酸（short tandem repeats）一般在不同的人里面但会起因变化，因此在自然科学里面运用于DNA匹配。但这种核酸若是显现在有机体两组采样里面，是不是能构成一个有用的DNA标记呢？Allen声称迄今还无法具体，但它在公众特殊适度DNA文档的显现率的减低增加了这种意味著适度。《基因两组分析》声称，只要NIH能从其文档里面除去已知的全人类基因核酸，那么他们就首肯登载Allen及其工作团队的论文。纽约基因两组里面心（New York Genome Center）的计数生理学Yaniv Erlich所带领的工作团队正是在***基因两组分析里面比对借助于了受试者。他声称，虽然仅基于有机体两组来比对借助于某人的比率很低，但分析者们理应实施前提的措施来管控与生俱来资料。而佛罗里达州休斯敦扎萨克医学院（Baylor College of Medicine）的生物学家Amy McGuire声称，由于参予HMP的受试者都已被告知可能适度发挥作用，所以他看来，不应该但会显现针对此事的非理适度恐慌。但是，催化过度却意味著但会减缓人们对有机体两组的探究向后。位于印第安纳州贝特里达的NIH附属国立全人类基因两组分析所（National Human Genome Research Institute）的政策负责人Laura Rodriguez声称，只要管控措施到位，比如尽意味著地将全人类DNA从HMP文档里面去除，那么“我们将想保持其大门开放日，毕竟它能为科学增添重要性。”原始借助于处:Ewen Callaway.Microbiomes raise privacy concerns.Nature, May 11, 2015.doi:10.1038/521136a